奇台县妇幼保健始终坚持“以保健为中心，保健与临床相结合，面向基层，面向群体”的办院方向，坚持“儿童优行，母亲安全”的服务宗旨，承担全县妇女儿童的医疗保健、健康教育、培训、妇幼卫生信息四大任务，是全县妇幼保健业务指导中心。
业务科室设置有产科、妇科、儿童保健科、婚前保健科、妇幼保健科、内儿科、外科（肛肠科）、口腔科、皮肤科、B超室、检验室。开展的服务项目有：孕产妇围产期保健、儿童保健、计划免疫、妇女病查治、外科、内儿科常见病治疗、皮肤病治疗、计划生育技术服务、不孕不育症治疗、推广母乳喂养等。编制床位48张，实际开设床位40张。现有主要医疗设备有：救护车、彩色麦迪逊6000C型B超、麻醉机、红外线乳腺检查仪、监护仪、三道心电图机、半自动生化分析仪、酶标仪、新生儿抢救台、血红蛋白测定仪、固有萤光检测诊断仪、宫腔镜、电子阴道镜、胎儿监护仪等先进医疗设备。其中妇科开展的腹腔镜手术、子宫肌瘤介入疗法、阴式全子宫切除术；产科开展导乐分娩、婴儿抚触、新生儿听力筛查、无痛分娩；新生儿急救、早产和极低体重儿的救治及护理，在全县居于领先水平。
奇台县妇幼保健院曾于1996年被昌吉州卫生局授予“文明妇幼保健院”称号；1996年11月国家卫生部授予“全国妇幼卫生工作先进单位”称号；1997年9月授予“爱婴医院”称号；该院2004年被自治区确定为妇幼卫生监测县和“降消”项目县。